WordPressフォーラム » WPtouchでカスタム投稿を表示することは可能ですか？

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PCテーマのfunctions.phpに書いているのであれば、WPtouchで表示された場合には読み込まれないため、カスタム投稿タイプ自体が登録されません。
プラグインで登録するようにするか、WPtouchのfunctions.phpに記述する必要があります。